278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1237 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  36.82 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.69 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.1 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  33.78 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  36.13 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  30.88 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.07 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.8 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>