135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3026 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  87.78 
 
 		 181 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  54.64 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  52.12 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 213 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 203 aa  91.3  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 216 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  32.26 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  28.93 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  28.31 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  28.86 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.12 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 383 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  28.48 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  26.01 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>