190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0091 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  37.27 
 
 		 266 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.21 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.98 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.3 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.78 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  32.03 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  37.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  34.17 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>