More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3008 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 
206 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  51.83 
 
 
214 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
204 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
214 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
214 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  47.7 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 
206 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 
208 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
205 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
194 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 
248 aa  88.6  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  36.47 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.07 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.29 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.42 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  33.91 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  33.88 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  45.92 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.76 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.11 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.39 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  32.57 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  32.45 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
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