226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2232 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.63 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  36.87 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 287 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.86 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>