268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2792 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
248 aa  484  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  54.46 
 
 
202 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 
193 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
206 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  39.72 
 
 
213 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 
209 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
202 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
191 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
191 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
191 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  34.42 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
197 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
189 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  33.17 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  36.36 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
191 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
188 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
192 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.48 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  27.98 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
193 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
201 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
205 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.24 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  28.86 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.93 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  38.79 
 
 
188 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  30.71 
 
 
181 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
195 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
194 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  46.24 
 
 
203 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
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NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.61 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.71 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
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NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
199 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  28.19 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
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