163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8134 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  54.4 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  50 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.54 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.5 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  25.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.74 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.22 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>