More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3021 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  58.64 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 192 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  29.74 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 383 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  28.27 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.55 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.12 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  24.47 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2636  regulatory protein TetR  31.18 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  31.02 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>