More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1975 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  59.28 
 
 
237 aa  228  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  53.37 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 
199 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  52.02 
 
 
208 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  42.46 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
205 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
194 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  39.66 
 
 
191 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
207 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  34.5 
 
 
182 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
202 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
192 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
234 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
216 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
216 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
216 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
191 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
203 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
383 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
287 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
224 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.46 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
178 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.18 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  28.85 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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