192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0873 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  44.97 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 193 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  35.09 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  27.55 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  33 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.92 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.44 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  27.41 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  43.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.68 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>