292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1585 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 200 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 208 aa  267  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  57.95 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.98 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  23.12 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  42.55 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
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NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
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NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.88 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
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