242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1821 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
200 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
200 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
208 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
187 aa  134  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  40.74 
 
 
211 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
200 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
208 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
193 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
184 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
184 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  34.68 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.59 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  41.18 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
287 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  36.56 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  30.53 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.64 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  36.56 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 
245 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  26.59 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  35.16 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
383 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 
182 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
234 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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