194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0872 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.09 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  43.21 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 287 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  39.17 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.51 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 383 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>