More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5887 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 193 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  35.89 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.74 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  41.43 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 98 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>