More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8864 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  29.45 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  23.66 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  36.56 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>