More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1835 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  56.99 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  56.48 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  54.17 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  43.08 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  27.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  27.39 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  25.47 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>