More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0963 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  29.53 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  25.5 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 309 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>