179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0364 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  66.84 
 
 		 190 aa  272  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  27.33 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  30.67 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  27.56 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  23.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  27.81 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  26.82 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  26.82 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  23.91 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  21.3 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  42.62 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  46.43 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  32.84 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  39.22 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  24.04 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  41.82 
 
 		 89 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>