164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2667 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  29.45 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  27.49 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  29.3 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  30.92 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  26.88 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  23.5 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  25.14 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  28.29 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  45 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  26.56 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  27.27 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  24.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  23.33 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  25.31 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  20.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  24.1 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>