32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  43.98 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  28.42 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  27.62 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  24.86 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  24.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  33.93 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  24.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  34.55 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  19.9 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>