125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2963 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 219 aa  84.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  26.78 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  32.32 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  22.54 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  22.54 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  23.7 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  34.72 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  35.62 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  21.31 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  19.39 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  23.03 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  27.35 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  28.75 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  31.07 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>