75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  20.81 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  41.51 
 
 		 289 aa  51.2  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  29.17 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  40.82 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.21 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  40.82 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  20.81 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  29.03 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 190 aa  44.7  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  40 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  29.67 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  33.93 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  24.72 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>