More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3058 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  29.02 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 306 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 332 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  38.24 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.21 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  26.85 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  58.06 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  32.73 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  26.81 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>