131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1104 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1447  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.456652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  48.57 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 192 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 189 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  25.93 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  32.86 
 
 		 184 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  32.86 
 
 		 184 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.29 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  19.64 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  19.64 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  34.69 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  20.61 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.91 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>