26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  43.98 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  25.95 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 190 aa  45.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>