85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  67.4 
 
 		 189 aa  254  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  45.09 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  31.11 
 
 		 289 aa  88.6  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  27.5 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  28.75 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  20.81 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  27.78 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  24.71 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  21.31 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  22.22 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  25.95 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  20.24 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  24.14 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  21.34 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  20.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  20.73 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  34.69 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  36.07 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  17.92 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 200 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 191 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 235 aa  41.6  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  18.18 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  18.18 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>