37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1164 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0254  hypothetical protein  43.33 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04190  transcriptional regulator, tetR family  34.73 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  28.49 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  21.25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  32.5 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  26 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  25.9 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  34.69 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  21.82 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  26.97 
 
 		 210 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 185 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 184 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 184 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  51.52 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  22.12 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>