More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2233 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  85.33 
 
 		 183 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  74.38 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  62.01 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  37.04 
 
 		 236 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 324 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34 
 
 		 390 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 438 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 325 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  34.82 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 261 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>