168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2227 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  85 
 
 
181 aa  315  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 
183 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  61.73 
 
 
173 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  61.73 
 
 
173 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
173 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  59.65 
 
 
187 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
236 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
262 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
268 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 
219 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
438 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
210 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 
247 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 
264 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
213 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
218 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  43.66 
 
 
232 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
324 aa  47.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  49.06 
 
 
195 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  44 
 
 
390 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  45.83 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
241 aa  45.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  37.29 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
205 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
200 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
201 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
213 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  33.33 
 
 
264 aa  44.7  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
193 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  45.83 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
325 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  38.33 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>