More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3779 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  47.03 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 178 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  35.65 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  37.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  46.67 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 470 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>