167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1188 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  70.28 
 
 		 217 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  21.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  24.03 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  30 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>