189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4590 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  100 
 
 		 206 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 275 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 256 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  24.46 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.6 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  30.06 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  36.73 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 317 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>