170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1508 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  97.56 
 
 		 205 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  74.38 
 
 		 208 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  44.39 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  30 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  32.85 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 321 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  42.11 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  51.11 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  47.46 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  30.34 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.96 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>