More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11281 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 
193 aa  240  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 
206 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  60.56 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  60.56 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  60.56 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  45.45 
 
 
192 aa  148  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 
194 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  27.96 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  30.69 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  28.57 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 
233 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  41.03 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
197 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  33.03 
 
 
201 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
220 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 
209 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
190 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.71 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
260 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  39.24 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.07 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
252 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.12 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  34.48 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
217 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
262 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
261 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
274 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  24.86 
 
 
390 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
235 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
263 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>