More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1753 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 
210 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  54.77 
 
 
211 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.64 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  20.87 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  20.3 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  20.3 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  19.8 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
201 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
193 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  32.97 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.14 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  20.9 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
191 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.66 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  18.01 
 
 
176 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
220 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  20.9 
 
 
191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
199 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>