More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3795 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  38.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.94 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 309 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  53.19 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2937  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0625018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  29.2 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  29.87 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  23.56 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 343 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  43.1 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  47.17 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>