228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13075 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 213 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  38.93 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  29.93 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  30.7 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  31.73 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  29.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.65 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 376 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 446 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>