More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0626 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  26.21 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  29.58 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  29.7 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>