216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1790 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 213 aa  334  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 212 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 302 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3129  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.82 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.22 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  26 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 275 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>