92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4627 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  38.89 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  20.63 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  21.57 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  25.3 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  24.46 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  25.89 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 215 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 260 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  37 
 
 		 206 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 203 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.05 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>