More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1909 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 195 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.98 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  27.33 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  26.38 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  28.88 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  27.67 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  23.04 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 403 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.44 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  23.96 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  24.73 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25.64 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25.64 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25.64 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25.64 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  23.66 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  23.71 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  0.00000191569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  26.11 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>