More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0104 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.85 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  32.41 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.92 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  28.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  25.37 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  24.63 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  24.24 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  25.26 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  29.29 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  30.15 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0476  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.36714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  24.63 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 309 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  23.29 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  28.57 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>