More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1046 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 202 aa  224  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  58.08 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  58.16 
 
 		 202 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 139 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  44.83 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  29.87 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  35.88 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  25.16 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  24.53 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.25 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  22.98 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  26.15 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  26.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  26.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  25.64 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  29.1 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  25.38 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  23.46 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  23.21 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  23.46 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  23.46 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  23.46 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  24.86 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  26.56 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  24.62 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  23.84 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  25.38 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  22.6 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  23.27 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  21.52 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  21.74 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  26.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  21.74 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  21.74 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  25.6 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  21.74 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  21.74 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  23.12 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  21.88 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  22.44 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  22.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  23.85 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  23.85 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  23.85 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  21.88 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>