261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4845 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  93.4 
 
 		 198 aa  353  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  92.89 
 
 		 198 aa  351  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  91.41 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  91.41 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  91.41 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  88.38 
 
 		 198 aa  339  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  87.88 
 
 		 198 aa  334  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  333  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  85.35 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  84.85 
 
 		 198 aa  330  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  68.59 
 
 		 196 aa  276  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  68.69 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  68.06 
 
 		 196 aa  275  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  66.49 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  61.93 
 
 		 197 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  61.93 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  61.93 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  61.93 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  61.42 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  61.42 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  59.9 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  61.42 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  61.42 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  60.91 
 
 		 197 aa  239  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  61.93 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  59.39 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  59.39 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  61.2 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  55.56 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  59.9 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  59.39 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  55.67 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  57.87 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  57.87 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  52.85 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  54.74 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  49.46 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  52.58 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  49.73 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  55.37 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  50.81 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  48.96 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  48.6 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  48.07 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  45.21 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  45.9 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  42.51 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  46.93 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  44.57 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2257  nucleoid occlusion protein  48.28 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.178912  hitchhiker  0.0000216309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  46.7 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  45.56 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0589  nucleoid occlusion protein  47.19 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45381  normal  0.299357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  46.07 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  0.00000191569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  44.79 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  42.86 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  45 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  42.41 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  42.41 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  42.41 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  42.41 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  41.88 
 
 		 229 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  41.88 
 
 		 229 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  45.05 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  47.49 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  42.86 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  42.5 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  41.15 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  42.55 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  42.55 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  41.27 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  41.8 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  40.72 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  41.08 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  43.41 
 
 		 216 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  43.41 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  43.68 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>