More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1059 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 202 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  51.31 
 
 		 200 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  51.5 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  44.77 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 139 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  41.76 
 
 		 186 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  29.32 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  26.9 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  27.07 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  30.39 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  29.41 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  31.73 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  31.73 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  31.73 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  28.97 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  29.25 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  30.12 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  28.26 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.01 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  28.17 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  31 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  29.29 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  31.13 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  27.74 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  26.55 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  34.33 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  29.06 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  27.45 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  24.14 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  27.41 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  28.32 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  27.78 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  28.85 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  24.63 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  24.63 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>