43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2838 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  57.06 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  51.05 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  49.54 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.95 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.13 
 
 		 220 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.13 
 
 		 220 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>