More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0144 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  74.13 
 
 		 202 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  74.13 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  74.13 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  74.13 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  73.63 
 
 		 202 aa  312  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  61.62 
 
 		 200 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  52.76 
 
 		 203 aa  234  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  59.5 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 139 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  44.06 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  24.84 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  26.95 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  30.83 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  24.07 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  29.36 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.17 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  29.73 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  29.19 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  28.83 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  28.83 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  23.95 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  28.83 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.69 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  28.83 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.31 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  26.49 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  25.17 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  25.89 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  25.17 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  30.23 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  26.53 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  28.28 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  27.45 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  23.27 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  30.09 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  26.13 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  23.89 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  26.55 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  23.35 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  24.84 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  25.85 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  23.08 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  23.4 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>