More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1045 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 195 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  29.82 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  29.05 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.59 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  30 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  18.59 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  25.79 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  26.71 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.29 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  26.83 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  26.95 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  26.76 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  29.79 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  26.67 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  27.59 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  26.24 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  24.65 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  24.8 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  28.19 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  29.26 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  27.81 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>