More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0355 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.21 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  18.97 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  19.68 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  18.23 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  26.63 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  21.58 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  21.21 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  18.35 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  19.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  19.23 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>