More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4280 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  23.76 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  18.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.85 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.48 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 437 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  27.11 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  37.68 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>